Biologie structurale computationnelle
Prédiction et analyse des structures protéiques tridimensionnelles à partir des séquences d'acides aminés.
Cadre scientifique
De la séquence au renseignement moléculaire
Les fondements de la biologie computationnelle qui alimentent les capacités analytiques de BE-PROTECT.
Analyse des protéines intrinsèquement désordonnées
Caractérisation des régions protéiques dépourvues de structure 3D stable – un élément clé de la biologie des agents pathogènes.
Biologie des réseaux d'interactions protéiques
Prédiction et analyse des interactions physiques et fonctionnelles à l'interface agent pathogène-hôte.
Annotation fonctionnelle pilotée par l'IA
Attribution de fonctions biologiques à des protéines non caractérisées à l'aide de l'apprentissage automatique, au-delà de l'homologie de séquence.
Conception de protéines assistée par IA
Conception computationnelle de domaines protéiques sur charpente et de mini-binders de novo pour la biodétection et les candidats thérapeutiques.
Pipeline IA & computationnel
Architecture du pipeline en six étapes
| Étape | Sous-titre | Résultat |
|---|---|---|
| 1. Acquisition génomique | Collecte des données & contrôle qualité | Séquences protéomiques nettoyées |
| 2. Prédiction structurale | Modélisation protéique par IA | Modèles 3D avec annotations |
| 3. Analyse de la flexibilité des protéines | Désordre & dynamique conformationnelle | Cartes de flexibilité et annotations de désordre |
| 4. Renseignement moléculaire | Réseaux d'interactions & évaluation des menaces | Profils de menace et de vulnérabilité |
| 5. Découverte de contre-mesures | Défenses moléculaires conçues par IA | Candidats contre-mesures classés |
| 6. Résultat opérationnel | Aide à la décision et produits de renseignement | Briefings de menace déployables |
Applications en biodéfense
Caractérisation de nouveaux agents pathogènes, évaluation des bioagents modifiés, préparation aux pandémies, renseignement de biosurveillance et biodéfense médico-légale.
Plateforme technologique
Infrastructure GPU/HPC, environnements de traitement sécurisés, pile logicielle modulaire et modèles de déploiement opérationnel.
Capacités pilotes
Scénarios pilotes opérationnels validant l'analyse rapide, la génération de biocapteurs, l'intégration de la biosurveillance et le soutien aux exercices.
Publications & résultats
Résultats de la recherche
BE-PROTECT Publications
The BE-PROTECT project is currently in its early phase. Publications and scientific outputs will be listed as they become available.