Computergestützte Strukturbiologie
Vorhersage und Analyse dreidimensionaler Proteinstrukturen anhand von Aminosäuresequenzen.
Wissenschaftlicher Rahmen
Von der Sequenz zu molekularen Erkenntnissen
Die Grundlagen der computergestützten Biologie, die die analytischen Fähigkeiten von BE-PROTECT antreiben.
Analyse intrinsisch ungeordneter Proteine
Charakterisierung von Proteinregionen ohne stabile 3D-Struktur – ein entscheidender Bestandteil der Pathogenbiologie.
Biologie von Proteininteraktionsnetzwerken
Vorhersage und Analyse physikalischer und funktioneller Interaktionen an der Pathogen-Wirt-Grenzfläche.
KI-gestützte funktionelle Annotation
Zuordnung biologischer Funktionen zu uncharakterisierten Proteinen mittels ML, über die Sequenzhomologie hinaus.
KI-gestützter Proteinentwurf
Computergestützter Entwurf von Proteindomänen auf Gerüststrukturen und von De-novo-Mini-Bindern für Biosensorik und therapeutische Kandidaten.
KI & computergestützte Pipeline
Pipeline-Architektur in sechs Stufen
| Stufe | Untertitel | Ergebnis |
|---|---|---|
| 1. Genomische Erfassung | Datenaufnahme & Qualitätskontrolle | Bereinigte Proteomsequenzen |
| 2. Strukturvorhersage | KI-gestützte Proteinmodellierung | 3D-Modelle mit Annotationen |
| 3. Analyse flexibler Proteine | Ungeordnetheit & konformationelle Dynamik | Flexibilitätskarten und Annotationen der Ungeordnetheit |
| 4. Molekulare Erkenntnisse | Interaktionsnetzwerke & Bedrohungsbewertung | Bedrohungs- und Schwachstellenprofile |
| 5. Entdeckung von Gegenmaßnahmen | KI-entworfene molekulare Abwehr | Bewertete Kandidaten für Gegenmaßnahmen |
| 6. Operatives Ergebnis | Entscheidungsunterstützung und Erkenntnisprodukte | Einsatzfähige Bedrohungsbriefings |
Anwendungen der Bioabwehr
Charakterisierung neuartiger Pathogene, Bewertung gentechnisch veränderter Bioagenzien, Pandemievorsorge, Biosurveillance-Erkenntnisse und forensische Bioabwehr.
Technologieplattform
GPU/HPC-fähige Infrastruktur, gesicherte Verarbeitungsumgebungen, modularer Software-Stack und operative Bereitstellungsmuster.
Pilotfähigkeiten
Operative Pilotszenarien zur Validierung von Schnellanalyse, Biosensorerzeugung, Biosurveillance-Integration und Übungsunterstützung.
Veröffentlichungen & Ergebnisse
Forschungsergebnisse
BE-PROTECT Veröffentlichungen
The BE-PROTECT project is currently in its early phase. Publications and scientific outputs will be listed as they become available.